Что такое RPATH? Wikipedia:
rpath is a term in programming which refers to a run-time search path hard-coded in an executable file or library, used during dynamic linking to find the libraries the executable or library requires.
Иными словами это жёстко зашито в заголовке бинарника. Можно попробовать поменять в момент запуска:
LD_LIBRARY_PATH=/var/other myprog &
Но это не всегда возможно и не всегда работает. Для постоянного изменения существует специальные утилиты, которые правят сам бинарник.
FreeBSD
В портах есть devel/chrpath
OpenBSD
Можно скачать исходники и скомпиллировать
Linux
Доступен во многих репозиториях пакет chrpath
Nowadays on Linux you should specify a RUNPATH, not a RPATH. The RUNPATH allows LD_LIBRARY overrides to search paths. It is recommended by the folks who write the runtime loaders. The options you need are: * -Wl,-rpath,(enables RPATH) * -Wl,--enable-new-dtags (enables RUNPATH)
Solaris
Тут целый набор команд для просмотра, правки не только rpath, но и многих других секций:
elfdump, elfedit, elffile, elfsign, elfwrap