Представим себе ситуацию: mysql у вас стоит на одной машине, а php – на другой. И вам нужно добавить поддержку pdo_mysql в php. Тянуть mysql на машину с php не надо, достаточно лишь создать каталог /usr/mysql и в нём такие каталоги:
lib/mysql – сюда скопировать либы libmysqlclient.so и libmysqlclient_r.so
bin – сюда скопировать mysql_config
include – сюда скопировать заголовочные файлы
Этого достаточно, что бы собрать pdo_mysql.
Тестовый стенд: Solaris 11, php-5.4.3 (php установлен в /usr/php54)